RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ASB9Q96DX5 294 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINB12Q96P63 405 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 DNTTIP1Q9H147 329 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 PSME2Q9UL46 239 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 INSRP06213 1382 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 LYRM9A8MSI8 78 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 HRH1P35367 487 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 PSG5Q15238 335 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TTLL9Q3SXZ7 439 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC19Q96DA6 116 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 PTTG3PQ9NZH4 202 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 HIDE1A8MVS5 230 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 RAB3DO95716 219 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 BCKDHBP21953 392 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 DCKP27707 260 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 DRD3P35462 400 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 HMGCS1Q01581 520 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD22Q5VYY1 191 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 OAFQ86UD1 273 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 KATNAL2Q8IYT4 538 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 PRELID2Q8N945 189 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 NYAP2Q9P242 653 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 CLN8Q9UBY8 286 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 NFASCO94856 1347 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 TTC41PQ6P2S7 1318 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 LTBP1Q14766 1721 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-212ENST00000491302 FAM166BA8MTA8 275 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PES1O00541 588 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 KMOO15229 486 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SUPT3HO75486 399 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 UTS2O95399 124 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ACSM4P0C7M7 580 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 STAG3L3P0CL85 134 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF30P17039 623 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 GSTM3P21266 225 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 NAMPTP43490 491 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PAX5Q02548 391 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PIGGQ5H8A4 983 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 STRADAQ7RTN6 431 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MKXQ8IYA7 352 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PQLC3Q8N755 202 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PRRC1Q96M27 445 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 KCNJ16Q9NPI9 418 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MEGF6O75095 1541 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 H7C0C1 242 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PANO1I0J062 215 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 DPM1O60762 260 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SRP72O76094 671 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A27O95847 323 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ADRB3P13945 408 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 LHX2P50458 406 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 KRT71Q3SY84 523 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 BEX5Q5H9J7 111 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM150AQ86TG1 271 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MDS2Q8NDY4 140 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
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