RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 PCSK4Q6UW60 755 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR6V1Q8N148 313 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RGMAQ96B86 450 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 REEP4Q9H6H4 257 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LANCL2Q9NS86 450 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TMEM210A6NLX4 147 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CIDEAO60543 219 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 UBL3O95164 117 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IFNA10P01566 189 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RPA2P15927 270 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF28P17035 718 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MVDP53602 400 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 DGCR2P98153 550 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PITPNAQ00169 270 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FOXO1Q12778 655 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RAB40BQ12829 278 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GAMTQ14353 236 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 KRT33BQ14525 404 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 F2RL3Q96RI0 385 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TMED9Q9BVK6 235 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OPN4Q9UHM6 478 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GX78 115 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SOCS6O14544 535 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 KLF4O43474 513 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GUSBP08236 651 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MGMTP16455 207 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SDC1P18827 310 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TACR1P25103 407 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CD200P41217 278 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 WNT3P56703 355 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ACSM1Q08AH1 577 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GAGE1Q13065 139 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SYT14P1Q58G82 188 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF626Q68DY1 528 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FGF11Q92914 225 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TSSK3Q96PN8 268 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CHST5Q9GZS9 411 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FRYQ5TBA9 3013 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GVC2 190 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CPED1A4D0V7 1026 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 A6NIN4 97 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IMPA2O14732 288 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF749O43361 778 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 STK16O75716 305 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 KRT33AO76009 404 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 QDPRP09417 244 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LIMS3P0CW19 117 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LIMS4P0CW20 117 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CCL4P13236 92 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NQO2P16083 231 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ABOP16442 354 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ABCD3P28288 659 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TLE3Q04726 772 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PEA15Q15121 130 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MPPED2Q15777 294 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MAL2Q969L2 176 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IL17FQ96PD4 163 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms