RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 RGNQ15493 299 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SLC36A2Q495M3 483 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 OR5J2Q8NH18 312 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF566Q969W8 418 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ITCHQ96J02 903 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 HAO1Q9UJM8 370 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 A0A0B4J2E0 115 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1B0GX12 115 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PLSCR5A0PG75 271 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 TM9SF1O15321 606 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ENTPD5O75356 428 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 OR6A2O95222 327 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PTHP01270 115 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 IGHMP01871 453 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF12P17014 697 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 GCH1P30793 250 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 APLNRP35414 380 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 MMP15P51511 669 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PLP2Q04941 152 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 OR1Q1Q15612 314 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 THEM4Q5T1C6 240 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 LRRC18Q8N456 261 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SYT14Q8NB59 555 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 OR6X1Q8NH79 312 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PKP2Q99959 881 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 RMND5AQ9H871 391 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 NOTCH1P46531 2555 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 BIRC5O15392 142 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SLC22A3O75751 556 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV2-70P01814 119 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 QDPRP09417 244 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ETS2P15036 469 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 CDH12P55289 794 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 HSF2Q03933 536 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 STX3Q13277 289 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 NXNQ6DKJ4 435 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 NPTNQ9Y639 398 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 CLDN34H7C241 214 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 CLIC1O00299 241 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 RNF13O43567 381 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 KNG1P01042 644 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PGA4P0DJD7 388 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PGA3P0DJD8 388 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 PARP8Q8N3A8 854 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 WFDC12Q8WWY7 111 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 ARMCX1Q9P291 453 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC40-211ENST00000574099 TPST2O60704 377 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 MT-ATP6P00846 226 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 KITP10721 976 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 IDO1P14902 403 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 WNT5AP41221 380 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 CLRN1P58418 232 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 BST1Q10588 318 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 SPICQ8N5J4 248 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF347Q96SE7 839 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 DIRC2Q96SL1 478 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 MSL2Q9HCI7 577 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.4 ms