RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 MALT1Q9UDY8 824 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 B9D1Q9UPM9 204 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 LAMA5O15230 3695 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ESPL1Q14674 2120 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 CCL21O00585 134 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 PHYHO14832 338 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 DHHO43323 396 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 GNAO1P09471 354 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ZNF823P16415 610 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SPI1P17947 270 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 AGAP20933 346 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 LAP3P28838 519 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 MPGP29372 298 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 CAPZA2P47755 286 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 MTNR1AP48039 350 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SELENOPP49908 381 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 PRSS12P56730 875 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 PCBD1P61457 104 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ACTC1P68032 377 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ACTA1P68133 377 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TLE1Q04724 770 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 GGTLC2Q14390 218 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 KCNMB1Q16558 191 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 C4orf17Q53FE4 359 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 KLHL12Q53G59 568 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 OR7E24Q6IFN5 339 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 Q6ZT83 130 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ZNF627Q7L945 461 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SHFQ7M4L6 423 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SYT14Q8NB59 555 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 OR10H5Q8NGA6 315 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 BOD1Q96IK1 185 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TEAD3Q99594 435 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 NUAK2Q9H093 628 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TINAGQ9UJW2 476 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 FAM20BO75063 409 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ENTPD6O75354 484 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TNFSF13O75888 250 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TNFAIP8O95379 198 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SLC2A10O95528 541 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 CLIC3O95833 236 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 KLK2P20151 261 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SLC2A5P22732 501 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 DCKP27707 260 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 GSTT1P30711 240 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 GABARAPL2P60520 117 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 HSF2Q03933 536 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 APOFQ13790 326 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TEX30Q5JUR7 227 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 FAM27BQ5VT28 67 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 CARD17Q5XLA6 110 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 RHOUQ7L0Q8 258 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SYT9Q86SS6 491 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 P2RY8Q86VZ1 359 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 OR6V1Q8N148 313 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ZNF843Q8N446 348 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 OR6K6Q8NGW6 343 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 STARD4Q96DR4 205 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 OR10A4Q9H209 315 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 NELFAQ9H3P2 528 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 MARCH7Q9H992 704 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SIAEQ9HAT2 523 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms