RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 NIPAL3Q6P499 406 aa14.84□□□□□ -0.03
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PACS1-208ENST00000529677 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
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PACS1-208ENST00000529677 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.84□□□□□ -0.03
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PACS1-208ENST00000529677 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
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PACS1-208ENST00000529677 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.82□□□□□ -0.04
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PACS1-208ENST00000529677 SLC2A10O95528 541 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 NR2C1P13056 603 aa14.82□□□□□ -0.04
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PACS1-208ENST00000529677 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 PIGMQ9H3S5 423 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF9O43307 516 aa14.81□□□□□ -0.04
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PACS1-208ENST00000529677 HEXAP06865 529 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 ZNF3P17036 446 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 CSNK1A1P48729 337 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 SLC25A1P53007 311 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 CRMP1Q14194 572 aa14.81□□□□□ -0.04
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PACS1-208ENST00000529677 C10orf128Q5T292 105 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 ZNF691Q5VV52 312 aa14.81□□□□□ -0.04
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PACS1-208ENST00000529677 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 TMEM163Q8TC26 289 aa14.81□□□□□ -0.04
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PACS1-208ENST00000529677 RNF6Q9Y252 685 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.8□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 OR6C68A6NDL8 312 aa14.8□□□□□ -0.04
PACS1-208ENST00000529677 H7C1C5 153 aa14.8□□□□□ -0.04
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