RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 GCNT6Q5T4J0 391 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC2A7Q6PXP3 512 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 LINC00114Q6XXX2 140 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC16A14Q7RTX9 510 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SYT14Q8NB59 555 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ICA1LQ8NDH6 482 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 DEFB108BQ8NET1 73 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 DUX5Q96PT3 197 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 GPA33Q99795 319 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 KCNK9Q9NPC2 374 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF69Q9UC07 566 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 NUP50Q9UKX7 468 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 NOTCH1P46531 2555 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SPRY3O43610 288 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SNNO75324 88 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 PGA4P0DJD7 388 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 PGA3P0DJD8 388 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 KITP10721 976 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 MMP15P51511 669 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 IL13RA1P78552 427 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 HHATQ5VTY9 493 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 MSRB3Q8IXL7 192 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 C10orf111Q8N326 155 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 OR1J1Q8NGS3 322 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ST7LQ8TDW4 575 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 EVA1AQ9H8M9 152 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 MMP26Q9NRE1 261 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 PLEK2Q9NYT0 353 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 UBAP1Q9NZ09 502 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ISPDA4D126 451 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 UBDO15205 165 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 MGRN1O60291 552 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ADH4P08319 380 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 APLNRP35414 380 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ATP4BP51164 291 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 MELKQ14680 651 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF74Q16587 644 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 HIST3H3Q16695 136 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF718Q3SXZ3 478 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 LRIF1Q5T3J3 769 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF613Q6PF04 617 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 MCHR2Q969V1 340 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 OR52B2Q96RD2 323 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 EGLN1Q9GZT9 426 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SLITRK2Q9H156 845 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC13A4Q9UKG4 626 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIM33Q9UPN9 1127 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 AUP1Q9Y679 476 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 GMEB1Q9Y692 573 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 CLDN34H7C241 214 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF13O43567 381 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 FMO6PO60774 539 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SERPINB7O75635 380 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 CH25HO95992 272 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 GCH1P30793 250 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF154Q13106 437 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 BAMBIQ13145 260 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 MIDNQ504T8 468 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ARMCX4Q5H9R4 360 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM255AQ5JRV8 349 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 CEP85LQ5SZL2 805 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 THEM4Q5T1C6 240 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 MAVSQ7Z434 540 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF101Q8IZC7 436 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF607Q96SK3 696 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM38AQ9H6F2 299 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 NANSQ9NR45 359 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 SLAMF8Q9P0V8 285 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 KLHL21Q9UJP4 597 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 VWFP04275 2813 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A0G2JK05 382 aa12.6□□□□□ -0.39
ACTBP11-201ENST00000436287 PLSCR5A0PG75 271 aa12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms