RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 RECKO95980 971 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 HTR2CP28335 458 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 CD1CP29017 333 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 BLOC1S1P78537 153 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF616Q08AN1 781 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 Q6ZS52 159 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM234Q8WY98 164 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 HRH4Q9H3N8 390 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 BANF2Q9H503 90 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 CUTCQ9NTM9 273 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 VWA8A3KMH1 1905 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 NOTCH2Q04721 2471 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 OR5K3A6NET4 321 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 AIPO00170 330 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 CTSBP07858 339 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 CALCBP10092 127 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 ACHEP22303 614 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 P2RX1P51575 399 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 MC2RQ01718 297 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 SERTAD2Q14140 314 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM53BQ14153 422 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 SHHQ15465 462 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 ACKR1Q16570 336 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 GIMAP5Q96F15 307 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 MED30Q96HR3 178 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 EPPINO95925 133 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 PRKACAP17612 351 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF136P52737 540 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 EMP2P54851 167 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 RAET1LQ5VY80 246 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 MDGA2Q7Z553 956 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 ST8SIA2Q92186 375 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF681Q96N22 645 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 STACQ99469 402 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 POFUT1Q9H488 388 aa7.9□□□□□ -1.14
ANKRD42-202ENST00000393389 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 LOC285556D6RIA3 1793 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A0B4J2E0 115 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A1B0GX12 115 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 WRBO00258 174 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 PLPP2O43688 288 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 ICOSLGO75144 302 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 PMP2P02689 132 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 MLC1Q15049 377 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 PTPRDP23468 1912 aa7.9□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 BHLHE40O14503 412 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 RGS13O14921 159 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM225BP0DP42 221 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 ZIC1Q15915 447 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 ETFDHQ16134 617 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC36A2Q495M3 483 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD42-202ENST00000393389 TMUB2Q71RG4 321 aa7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms