RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 SHFQ7M4L6 423 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS48Q7RTY5 328 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 FGD2Q7Z6J4 655 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 GLB1L2Q8IW92 636 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 C20orf196Q8IYI0 205 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 OR52I1Q8NGK6 324 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 OR6N2Q8NGY6 317 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 LGALS12Q96DT0 336 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 INTS14Q96SY0 518 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 RHNO1Q9BSD3 238 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 CDADC1Q9BWV3 514 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00470Q9BZP3 86 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 DUSP21Q9H596 190 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 C12orf49Q9H741 205 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 POLR1DQ9Y2S0 133 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 EPG5Q9HCE0 2579 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 TVP23AA6NH52 213 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 DCTN6O00399 190 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 DHHO43323 396 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 SLC19A2O60779 497 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF432O94892 652 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 MT-ND2P03891 347 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 SBK2P0C263 348 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 LAP3P28838 519 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 TUBA4AP68366 448 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 SIRPAP78324 504 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ADAM8P78325 824 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 MVKQ03426 396 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 HSF2Q03933 536 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 PIGFQ07326 219 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ETFDHQ16134 617 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 SLC16A9Q7RTY1 509 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 SLC35F2Q8IXU6 374 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 GCNT2Q8N0V5 402 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM123Q8N131 208 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 OR10H4Q8NGA5 316 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 OR4F15Q8NGB8 312 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ZFP3Q96NJ6 502 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 FOXN4Q96NZ1 517 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 TBX5Q99593 518 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 INPP5EQ9NRR6 644 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 FKBP14Q9NWM8 211 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 C12orf71A8MTZ7 269 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF587BE7ETH6 402 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 PHYHO14832 338 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 SELENOFO60613 162 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 SPARCP09486 303 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 OR2T7P0C7T2 308 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 HIST3H3Q16695 136 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 C10orf128Q5T292 105 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 KCTD8Q6ZWB6 473 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 FAM214BQ7L5A3 538 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 WDFY1Q8IWB7 410 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 SPARTQ8N0X7 666 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 KLHL36Q8N4N3 616 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ACBD7Q8N6N7 88 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 C9orf106Q8NAJ2 232 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF511Q8NB15 262 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 OR6K3Q8NGY3 331 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 OR2T27Q8NH04 317 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 FCGR1BQ92637 280 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 MNTQ99583 582 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 MND1Q9BWT6 205 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 YIPF3Q9GZM5 350 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 KCNN2Q9H2S1 579 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ADGRL4Q9HBW9 690 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 LAMP5Q9UJQ1 280 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF835Q9Y2P0 537 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRK-201ENST00000368202 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms