RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 OR10A4Q9H209 315 aa15.63■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 NOX3Q9HBY0 568 aa15.63■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 DIABLOQ9NR28 239 aa15.63■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 TTLL8A6PVC2 850 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 DNASE1P24855 282 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 C1orf140Q5VVS0 124 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ANKRD16Q6P6B7 361 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 Q6ZTK2 550 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 GRINAQ7Z429 371 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 RNF128Q8TEB7 428 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 G3V3Q6 166 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 H0YC42 278 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ICMTO60725 284 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 TSC22D2O75157 780 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 CPN1P15169 458 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 DCTDP32321 178 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 PLA2G7Q13093 441 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SLC18B1Q6NT16 456 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 STK35Q8TDR2 534 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 A0A1B0GX78 115 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 H7C417 338 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 PLPP3O14495 311 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ADAM10O14672 748 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 DUX1O43812 170 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SLC16A7O60669 478 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 NDUFB6O95139 128 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 OR3A3P47888 321 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SELENOPP49908 381 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 LINC00303Q3SY05 128 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 C5orf46Q6UWT4 87 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 NLRC3Q7RTR2 1065 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 GLB1L2Q8IW92 636 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SPICQ8N5J4 248 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 PLPP5Q8NEB5 264 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 C8orf44Q96CB5 159 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 MTFP1Q9UDX5 166 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SLC22A23A1A5C7 686 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 MBTPS2O43462 519 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SLC22A5O76082 557 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 HLA-DQA2P01906 255 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 IL5P05113 134 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 IFNGR1P15260 489 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SLC35D2Q76EJ3 337 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 PRSS58Q8IYP2 241 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 OR2T35Q8NGX2 323 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 DNAJA3Q96EY1 480 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 DPYSL5Q9BPU6 564 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 A0A0C4DFX4 3053 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 GGT3PA6NGU5 568 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 CTLA4P16410 223 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 CSF2RBP32927 897 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 RAD52P43351 418 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ODF4Q2M2E3 257 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 FAM166AQ6J272 317 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 PRSS42Q7Z5A4 293 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 KMT5CQ86Y97 462 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 OR8K3Q8NH51 312 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 NXPE2Q96DL1 559 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SEC16AO15027 2179 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 OR2T1O43869 369 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 CTAG2O75638 210 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 RBBP9O75884 186 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 PNPP00491 289 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ALDOBP05062 364 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SLC25A25Q6KCM7 469 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 CITED4Q96RK1 184 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SLC17A5Q9NRA2 495 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 CA14Q9ULX7 337 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SNRPGP15A8MWD9 76 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 FTCDNL1E5RQL4 147 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SLC17A2O00624 439 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 OR6A2O95222 327 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ITGA5P08648 1049 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 CD37P11049 281 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 GLB1P16278 677 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CLDN11-201ENST00000064724 ETFDHQ16134 617 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms