RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614410.4

ALMS1-207, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ALMS1, Length 11,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-207ENST00000614410 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 C4orf47A7E2U8 309 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 PPP6CO00743 305 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 PPP1R2P9O14990 202 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 CSN1S1P47710 185 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 GIPRP48546 466 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 LGI3Q8N145 548 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 GPR119Q8TDV5 335 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 BLNKQ8WV28 456 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 MED18Q9BUE0 208 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 CDHR4A6H8M9 788 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 CNR1P21554 472 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 UBE2G1P62253 170 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 IGSF21Q96ID5 467 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 FCRL1Q96LA6 429 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 SCML1Q9UN30 329 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 KCNK5O95279 499 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 A0A087WV62 115 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 SLC43A1O75387 559 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 F2P00734 622 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 CSF3P09919 207 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 IQCF3P0C7M6 154 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 SDC1P18827 310 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 MMP12P39900 470 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 RAB40BQ12829 278 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 CLEC14AQ86T13 490 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 SIAH3Q8IW03 269 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 BTF3L4Q96K17 158 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 POLEQ07864 2286 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 USP32Q8NFA0 1604 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 G3V3Q6 166 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 TTRP02766 147 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 CYBAP13498 195 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 H3F3AP84243 136 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 CRMP1Q14194 572 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 SELPLGQ14242 412 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 AAED1Q7RTV5 226 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 ZNF320A2RRD8 509 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 PLSCR1O15162 318 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 FABP4P15090 132 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 AMTP48728 403 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 ACTBL2Q562R1 376 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 C3orf30Q96M34 536 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 KIAA1456Q9P272 454 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 CD207Q9UJ71 328 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 CBLCQ9ULV8 474 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 PTPRMP28827 1452 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 G3V2L1 256 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 ACP2P11117 423 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 S100A11P31949 105 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 WNT7BP56706 349 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 CORO6Q6QEF8 472 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 S1PR3Q99500 378 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 ARHGDIGQ99819 225 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 MAF1Q9H063 256 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 TMEM212A6NML5 194 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 GUSBP08236 651 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 HSD17B1P14061 328 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-207ENST00000614410 ZNF264O43296 627 aa6.59□□□□□ -1.36
ALMS1-207ENST00000614410 IAPPP10997 89 aa6.59□□□□□ -1.36
ALMS1-207ENST00000614410 GPX3P22352 226 aa6.59□□□□□ -1.36
ALMS1-207ENST00000614410 SLC5A2P31639 672 aa6.59□□□□□ -1.36
ALMS1-207ENST00000614410 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
ALMS1-207ENST00000614410 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.59□□□□□ -1.36
ALMS1-207ENST00000614410 WDR31Q8NA23 367 aa6.59□□□□□ -1.36
ALMS1-207ENST00000614410 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms