RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 CMPK1P30085 196 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 OR1Q1Q15612 314 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 PRRT3Q5FWE3 981 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 TMEM196Q5HYL7 178 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 ZNF836Q6ZNA1 936 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 PRSS41Q7RTY9 318 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 OR6N1Q8NGY5 312 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 PRSS27Q9BQR3 290 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 GAREM1Q9H706 876 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 CAPN10Q9HC96 672 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 FBXO34Q9NWN3 711 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 SIGLEC7Q9Y286 467 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 GPR89AB7ZAQ6 455 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 H7C417 338 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 BCL2L11O43521 198 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 CTSVO60911 334 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 ZFPL1O95159 310 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 ACTL6AO96019 429 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 OR4E1P0C645 316 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 OR2T7P0C7T2 308 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 GPR89BP0CG08 455 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 PEA15Q15121 130 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 PON3Q15166 354 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 ENPP7Q6UWV6 458 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 ARMC10Q8N2F6 343 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 KCNRGQ8N5I3 272 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 OR1J4Q8NGS1 313 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 OR10R2Q8NGX6 335 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 OR2T27Q8NH04 317 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 HSPA12BQ96MM6 686 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 C2orf42Q9NWW7 574 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 MTFP1Q9UDX5 166 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 ZNF281Q9Y2X9 895 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 EPOPA6NHQ4 379 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 GLSO94925 669 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 CSF1P09603 554 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 FBXO45P0C2W1 286 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 AKAIN1P0CW23 69 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 POU4F2Q12837 409 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 MPPED2Q15777 294 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 C5orf46Q6UWT4 87 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 NAA40Q86UY6 237 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 C15orf40Q8WUR7 153 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 CCDC107Q8WV48 283 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 FAM117AQ9C073 453 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 NCDNQ9UBB6 729 aa12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
NISCH-212ENST00000488380 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 EIF1P41567 113 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 MECP2P51608 486 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 RUNX2Q13950 521 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 DUSP5Q16690 384 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 FBXO42Q6P3S6 717 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 STAC2Q6ZMT1 411 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 PGAP1Q75T13 922 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 MTSS1LQ765P7 747 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 NRROSQ86YC3 692 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 FRMD1Q8N878 549 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 TMEM106CQ9BVX2 250 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 ACTRT3Q9BYD9 372 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 GON4LQ3T8J9 2241 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 TMEM82A0PJX8 343 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 M0QYG6 137 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 OR2T1O43869 369 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 LDB3O75112 727 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 OR2F2O95006 317 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 RPL4P36578 427 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 AQP2P41181 271 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 AKR1C3P42330 323 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 PPT1P50897 306 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 OR2F1Q13607 317 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 KCNAB1Q14722 419 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 MFSD12Q6NUT3 480 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 OR51D1Q8NGF3 324 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 OR10G6Q8NH81 332 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 PATE1Q8WXA2 126 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 ARL11Q969Q4 196 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 TAS2R8Q9NYW2 309 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-212ENST00000488380 FAM96BQ9Y3D0 163 aa12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms