RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 HCRTR2O43614 444 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 NDUFB5O43674 189 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 SERPINI2O75830 405 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 IGHMP01871 453 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ADRB1P08588 477 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 GP1BBP13224 206 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 GRPRP30550 384 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 NXPH1P58417 271 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 KMT5CQ86Y97 462 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 PLXDC1Q8IUK5 500 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 D2HGDHQ8N465 521 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 OR6S1Q8NH40 331 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 OR52I2Q8NH67 350 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 SNAPC3Q92966 411 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ZNF524Q96C55 264 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 YIPF2Q9BWQ6 316 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ZNF222Q9UK12 451 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 A0A1B0GUH1 482 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 GPR171O14626 319 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 NPIPB7O75200 414 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 RPP14O95059 124 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 AKR7A3O95154 331 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 OR1D4P47884 311 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 MECP2P51608 486 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 CBFBQ13951 182 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ST3GAL2Q16842 350 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TMEM69Q5SWH9 247 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 METTL11BQ5VVY1 283 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 OR1N1Q8NGS0 311 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 OR6N2Q8NGY6 317 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 MCHR2Q969V1 340 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ZNF304Q9HCX3 659 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 COPS7AQ9UBW8 275 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 SMLR1H3BR10 107 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 XKRYO14609 159 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ADRA2CP18825 462 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 HTR2BP41595 481 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 SLC29A4Q7RTT9 530 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 C9orf40Q8IXQ3 194 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ZNF441Q8N8Z8 693 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 STK35Q8TDR2 534 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 WWTR1Q9GZV5 400 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 B3GNT2Q9NY97 397 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 RCE1Q9Y256 329 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 C4orf47A7E2U8 309 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 A8MUA0 341 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 PSMD9O00233 223 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 SLC25A12O75746 678 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 DXOO77932 396 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 ARL4DP49703 201 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 P2RX1P51575 399 aa21.48■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 DEFB133Q30KQ1 61 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 OR11G2Q8NGC1 345 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ZNF519Q8TB69 540 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 C4orf45Q96LM5 186 aa21.48■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 FSCN3Q9NQT6 498 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 MGAT4AQ9UM21 535 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa21.47■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 COL28A1Q2UY09 1125 aa21.47■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 GAL3ST4Q96RP7 486 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 PTDSS2Q9BVG9 487 aa21.47■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 STEAP1Q9UHE8 339 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 B9D1Q9UPM9 204 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 PRSS37A4D1T9 235 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 A8MVM7 634 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 PATE3B3GLJ2 98 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TPOP07202 933 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 ZNF24P17028 368 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 CAMK2DQ13557 499 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TEX30Q5JUR7 227 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 IZUMO1Q8IYV9 350 aa21.47■■□□□ 1.03
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