RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SRMP19623 302 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 AOAHP28039 575 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HOXD13P35453 343 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 KIR2DL3P43628 341 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DMWDQ09019 674 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LMAN2Q12907 356 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GANABQ14697 944 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF789Q5FWF6 425 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 THEM4Q5T1C6 240 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SSX7Q7RTT5 188 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZFP82Q8N141 532 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GPR137CQ8N3F9 429 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GLIS3Q8NEA6 775 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF516Q92618 1163 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GPR62Q9BZJ7 368 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 METTL7AQ9H8H3 244 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ERVK13-1Q9NX77 482 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RNF11Q9Y3C5 154 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HIDE1A8MVS5 230 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SLCO2B1O94956 709 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SPDEFO95238 335 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FBLP22087 321 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PSMB6P28072 239 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CD200P41217 278 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SH3BP2P78314 561 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FOXK1P85037 733 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FOXO1Q12778 655 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM65Q6PI78 240 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR6N1Q8NGY5 312 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR6N2Q8NGY6 317 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HGDQ93099 445 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SLC35A4Q96G79 324 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TCTN2Q96GX1 697 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LMLNQ96KR4 655 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF75AQ96N20 296 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 VDAC3Q9Y277 283 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PLXNA2O75051 1894 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LINC01549A6NIU2 74 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 B4DGG1 531 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SCGB1D2O95969 90 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 POU2F2P09086 479 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 IL13RA2Q14627 380 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PLXDC2Q6UX71 529 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF679Q8IYX0 411 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR13C2Q8NGS9 318 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 KLRF1Q9NZS2 232 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GSKIPQ9P0R6 139 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 G3V3Q6 166 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RTCAO00442 366 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DOK2O60496 412 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SERPINA7P05543 415 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CTSLP07711 333 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM18P0DKX4 95 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CHRNB4P30926 498 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RAC1P63000 192 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ARSIQ5FYB1 569 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 APOOLQ6UXV4 268 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HTR3DQ70Z44 454 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 COX15Q7KZN9 410 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CSNK1A1LQ8N752 337 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RAB40CQ96S21 281 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM59Q9BXS4 323 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TAS2R16Q9NYV7 291 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 ALAS2P22557 587 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 OR5K2Q8NHB8 316 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TOLLIPQ9H0E2 274 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PLEK2Q9NYT0 353 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 ANHXE9PGG2 379 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF10CO14798 259 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 COCHO43405 550 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MT-ND6P03923 174 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SLC2A1P11166 492 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PKIAP61925 76 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1CAP62136 330 aa4.54□□□□□ -1.68
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