RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 XRCC3O43542 346 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 IGKV3-11P04433 115 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ITPKBP27987 946 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 IL12BP29460 328 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 RAD52P43351 418 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 DCAF7P61962 342 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 CBFBQ13951 182 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 PRR22Q8IZ63 422 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 FTMTQ8N4E7 242 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 SPICQ8N5J4 248 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 OTOSQ8NHW6 89 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 OR1F2PQ96R84 312 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 CUTCQ9NTM9 273 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 G3V3Q6 166 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 GMFGO60234 142 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 RBBP9O75884 186 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 NDUFB6O95139 128 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 SIX5Q8N196 739 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF721Q8TF20 911 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 MCHR2Q969V1 340 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 RP1P56715 2156 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 A0A1W2PPC1 479 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 SLC25A12O75746 678 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 CRYZL1O95825 349 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 NUDT14O95848 222 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 HLA-DQA2P01906 255 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 BGLAPP02818 100 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 OR1D4P47884 311 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ARPC4P59998 168 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ODF4Q2M2E3 257 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 DEFB123Q8N688 67 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 RLN3Q8WXF3 142 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 TSLPQ969D9 159 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 MARVELD3Q96A59 401 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF69Q9UC07 566 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 UBQLN2Q9UHD9 624 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 AUP1Q9Y679 476 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 MPC2O95563 127 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 IL5P05113 134 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 C4BPBP20851 252 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 TSPAN5P62079 268 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 PUDPQ08623 228 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 OR8K3Q8NH51 312 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 C4orf45Q96LM5 186 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 CHIAQ9BZP6 476 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 A0A1W2PQD3 144 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 C11orf98E9PRG8 122 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 SNAPC5O75971 98 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 DDAH2O95865 285 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 GPANK1O95872 356 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 MT-ATP6P00846 226 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 PGCP20142 388 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 WDR38Q5JTN6 314 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF626Q68DY1 528 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 FDX2Q6P4F2 183 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 CEP76Q8TAP6 659 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms