RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	CDH12	P55289	794 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	TAS2R41	P59536	307 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	MS4A2	Q01362	244 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	NAAA	Q02083	359 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	BNIP1	Q12981	228 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	OR7A5	Q15622	319 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ADIPOQ	Q15848	244 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	USP43	Q70EL4	1123 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	AAED1	Q7RTV5	226 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	C3orf56	Q8N813	242 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	JMJD8	Q96S16	334 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	SEPHS2	Q99611	448 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	DOK1	Q99704	481 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	SOX7	Q9BT81	388 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	NDE1	Q9NXR1	346 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	CD300A	Q9UGN4	299 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	5.93	□□□□□ -1.46	4e-8	■■■■■ 34.1
CS-233	ENST00000552688	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688		A0A0B4J2E0	115 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GX12	115 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	TMEM89	A2RUT3	159 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	FAM157A	C9JC47	383 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	TRIM77	I1YAP6	450 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	GMNN	O75496	209 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	SERPINI2	O75830	405 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	AKR7A3	O95154	331 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	VENTX	O95231	258 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	IFNA14	P01570	189 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	IGLV1-44	P01699	117 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	HSD17B1	P14061	328 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	IFNGR1	P15260	489 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	CBR1	P16152	277 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	EGR1	P18146	543 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	FUT1	P19526	365 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	LIMS1	P48059	325 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	EVX1	P49640	407 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	MNAT1	P51948	309 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ACTG1	P63261	375 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	SELENOW	P63302	87 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	IL1RL1	Q01638	556 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	RIN1	Q13671	783 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	IFI44L	Q53G44	452 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	TMEM225	Q6GV28	225 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	VHLL	Q6RSH7	139 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	CBLL1	Q75N03	491 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	KDM8	Q8N371	416 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	PFN4	Q8NHR9	129 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	SNX18	Q96RF0	628 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CS-233	ENST00000552688	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46

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