RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 NDUFA9Q16795 377 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CMPK2Q5EBM0 449 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 C1orf185Q5T7R7 199 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM205Q6UW68 189 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SNX20Q7Z614 316 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ANKRD37Q7Z713 158 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SNX32Q86XE0 403 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF567Q8N184 647 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 KIF2BQ8N4N8 673 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CSNK1A1LQ8N752 337 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 LINC01555Q8NAE3 123 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OR1B1Q8NGR6 318 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OR9A4Q8NGU2 314 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OR2L8Q8NGY9 312 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OR5K2Q8NHB8 316 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 C8orf46Q8TAG6 207 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 M1APQ8TC57 530 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 DTX3LQ8TDB6 740 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 MCOLN3Q8TDD5 553 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ITLN1Q8WWA0 313 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RAPGEF5Q92565 580 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 FAM162AQ96A26 154 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 HAUS1Q96CS2 278 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ERGIC2Q96RQ1 377 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CYTH2Q99418 400 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 NPAS2Q99743 824 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TTYH2Q9BSA4 534 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 DEFB126Q9BYW3 111 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RHBGQ9H310 441 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SMOXQ9NWM0 555 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CLEC5AQ9NY25 188 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CHMP5Q9NZZ3 219 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PCYOX1Q9UHG3 505 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 FBXW2Q9UKT8 454 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 GTF3C1Q12789 2109 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 A0A087X0K7 114 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SLC5A10A0PJK1 596 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PINLYPA6NC86 204 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF860A6NHJ4 632 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 IQCF5A8MTL0 148 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 A8MU10 97 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SGK494L7N484 410 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 FBP2O00757 339 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CASKO14936 926 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OR1I1O60431 355 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CST8O60676 142 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 B4GALT2O60909 372 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RDH16O75452 317 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP5-8O75690 187 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SERPIND1P05546 499 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PTMAP06454 111 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC159P0C7I6 412 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 IL1RNP18510 177 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ACKR3P25106 362 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SLC26A3P40879 764 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 NPBWR1P48145 328 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TRPC1P48995 793 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 HLCSP50747 726 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 MLF1P58340 268 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SLC26A5P58743 744 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 WASHC5Q12768 1159 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 GRB7Q14451 532 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TMED2Q15363 201 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 NSDHLQ15738 373 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PCK2Q16822 640 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TYSND1Q2T9J0 566 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CCSMST1Q4G0I0 132 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RTL6Q6ICC9 239 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 H3F3CQ6NXT2 135 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 EMBQ6PCB8 327 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF584Q8IVC4 421 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 C11orf53Q8IXP5 236 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 KRT222Q8N1A0 295 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 LIX1Q8N485 282 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OR2L3Q8NG85 312 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OR51Q1Q8NH59 317 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TSLPQ969D9 159 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RFT1Q96AA3 541 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RAD51AP1Q96B01 352 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TADA1Q96BN2 335 aa2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms