RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	BID	P55957	195 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	SOX8	P57073	446 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	OR12D2	P58182	307 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TAS2R43	P59537	309 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	RAC1	P63000	192 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	FOXO1	Q12778	655 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CDC20	Q12834	499 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CLN3	Q13286	438 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	MFAP5	Q13361	173 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CDON	Q4KMG0	1287 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TP53I3	Q53FA7	332 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	GPAT4	Q86UL3	456 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TIGD4	Q8IY51	512 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	SYS1	Q8N2H4	156 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	SNX33	Q8WV41	574 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	AGAP4	Q96P64	663 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	OXGR1	Q96P68	337 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	INTS14	Q96SY0	518 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A0J9YW62	118 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFSF11	O14788	317 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRTM2	O43300	516 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	NME2P1	O60361	137 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CLPX	O76031	633 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	GPANK1	O95872	356 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	HLA-DQA2	P01906	255 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CTLA4	P16410	223 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CEL	P19835	753 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	KLK2	P20151	261 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	NME2	P22392	152 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CRABP1	P29762	137 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CENPA	P49450	140 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	BLVRA	P53004	296 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TUBA1B	P68363	451 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	NHLH1	Q02575	133 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	VASN	Q6EMK4	673 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TUBA1A	Q71U36	451 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CDC20B	Q86Y33	519 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	SULF2	Q8IWU5	870 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC39A7	Q92504	469 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM203	Q969S6	136 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TXNDC15	Q96J42	360 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNK17	Q96T54	332 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	MNT	Q99583	582 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TMED9	Q9BVK6	235 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	MARCH7	Q9H992	704 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	GNG8	Q9UK08	70 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	POLH	Q9Y253	713 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	RASD1	Q9Y272	281 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	MED13	Q9UHV7	2174 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A0C4DFX4	3053 aa		11	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	KNTC1	P50748	2209 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	RAMP1	O60894	148 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	SP1	P08047	785 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CD46	P15529	392 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF43	P17038	809 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	RFC3	P40938	356 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	MEOX1	P50221	254 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	ARG2	P78540	354 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	FABP5	Q01469	135 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	PLGLB1	Q02325	96 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	FMOD	Q06828	376 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR50	Q13585	617 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM225	Q6GV28	225 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	ARL9	Q6T311	187 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDLBP-231	ENST00000467435	GGN	Q86UU5	652 aa		10.99	□□□□□ -0.65

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