RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625712.2

RAB34-222, Transcript of RAB34, member RAS oncogene family, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB34, Length 994 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB34-222	ENST00000625712	USP22	Q9UPT9	525 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAB34-222	ENST00000625712	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SASH3	O75995	380 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	CH25H	O95992	272 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ADORA3	P0DMS8	318 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	B4GALT1	P15291	398 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	GZMM	P51124	257 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	CRYBA2	P53672	197 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	BID	P55957	195 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	PIGF	Q07326	219 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	GGTLC2	Q14390	218 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ZNF74	Q16587	644 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	PXK	Q7Z7A4	578 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SVOPL	Q8N434	492 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	TMEM129	A0AVI4	362 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	IFNGR1	P15260	489 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	NPR2	P20594	1047 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	NR4A2	P43354	598 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	CSNK1A1	P48729	337 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	PPOX	P50336	477 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	GSG1	Q2KHT4	349 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	RABL3	Q5HYI8	236 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	KRT80	Q6KB66	452 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ZNF75A	Q96N20	296 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	KCNK17	Q96T54	332 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	DOK1	Q99704	481 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	FOXB1	Q99853	325 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	NANOG	Q9H9S0	305 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	NDUFS8	O00217	210 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	OR6A2	O95222	327 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	DAG1	Q14118	895 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	MELK	Q14680	651 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	MSMP	Q1L6U9	139 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	VMAC	Q2NL98	169 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ZNF627	Q7L945	461 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	CDK20	Q8IZL9	346 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	FXYD1	O00168	92 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	TNFRSF1B	P20333	461 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	NR4A1	P22736	598 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	GIPR	P48546	466 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ZP4	Q12836	540 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	CCDC80	Q76M96	950 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	OR6X1	Q8NH79	312 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	TMEM54	Q969K7	222 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	MPP4	Q96JB8	637 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAB34-222	ENST00000625712	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		13.11	□□□□□ -0.31

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