RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583254.1

CTC1-211, Transcript of CST telomere replication complex component 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTC1, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1-211ENST00000583254 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.9□□□□□ -1.46
CTC1-211ENST00000583254 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa5.9□□□□□ -1.46
CTC1-211ENST00000583254 RCE1Q9Y256 329 aa5.9□□□□□ -1.46
CTC1-211ENST00000583254 STK38LQ9Y2H1 464 aa5.9□□□□□ -1.46
CTC1-211ENST00000583254 NPTNQ9Y639 398 aa5.9□□□□□ -1.46
CTC1-211ENST00000583254 POMT1Q9Y6A1 747 aa5.9□□□□□ -1.46
CTC1-211ENST00000583254 TENM2Q9NT68 2774 aa5.9□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 DOCK11Q5JSL3 2073 aa5.9□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 HERC2O95714 4834 aa5.9□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 F5H0A9 414 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 K7EIL1 84 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 M0R3G1 203 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SPRY3O43610 288 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CRCPO75575 148 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 VAMP5O95183 116 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 C6orf47O95873 294 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 AK1P00568 194 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 IGHV1-46P01743 117 aa5.89□□□□□ -1.47
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CTC1-211ENST00000583254 LCKP06239 509 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PPIAL4GP0DN37 164 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 UROSP10746 265 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 LAMP1P11279 417 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CCL2P13500 99 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CPA3P15088 417 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 B4GALT1P15291 398 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZNF250P15622 560 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 KRT4P19013 534 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CRHR1P34998 444 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZNF81P51508 661 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RAB1AP62820 205 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RPL38P63173 70 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 EGR3Q06889 387 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SLC3A1Q07837 685 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RBBP4Q09028 425 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ESCO2Q56NI9 601 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SPRNQ5BIV9 151 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CFAP157Q5JU67 520 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 FAM209AQ5JX71 171 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CARD17Q5XLA6 110 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 C16orf62Q7Z3J2 963 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZNF584Q8IVC4 421 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 C4orf33Q8N1A6 199 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SPICQ8N5J4 248 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 POU5F2Q8N7G0 328 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 OR7A2PQ8NGA2 310 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SFXN5Q8TD22 340 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 DYRK2Q92630 601 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ITPKCQ96DU7 683 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 NEURL3Q96EH8 262 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TOR3AQ9H497 397 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PPCSQ9HAB8 311 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 C1orf109Q9NX04 203 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 EMCNQ9ULC0 261 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RASD1Q9Y272 281 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.89□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TM9SF1O15321 606 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PLIN3O60664 434 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 SPAG7O75391 227 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PPP1R3DO95685 299 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 IGHV4-59P01825 116 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 MT-ND5P03915 603 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 PATE4P0C8F1 98 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 THRBP10828 461 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 ZNF43P17038 809 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 DRD4P21917 467 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 MATN1P21941 496 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 FUT4P22083 530 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CXCR1P25024 350 aa5.88□□□□□ -1.47
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CTC1-211ENST00000583254 KCNJ10P78508 379 aa5.88□□□□□ -1.47
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CTC1-211ENST00000583254 FUT5Q11128 374 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CHI3L2Q15782 390 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CCDC153Q494R4 210 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TMEM255AQ5JRV8 349 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 LIPMQ5VYY2 423 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 WDR93Q6P2C0 686 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 BTNL3Q6UXE8 466 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 RNF130Q86XS8 419 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 TMEM123Q8N131 208 aa5.88□□□□□ -1.47
CTC1-211ENST00000583254 CLEC4FQ8N1N0 589 aa5.88□□□□□ -1.47
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