RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR171O14626 319 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BET1O15155 118 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NKX2-8O15522 239 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHP2O43745 196 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GMFGO60234 142 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYTIPO60759 359 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR6B1O95007 311 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DBHP09172 617 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INHBBP09529 407 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STAG3L3P0CL85 134 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRKACGP22612 351 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CASP3P42574 277 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM34P42696 430 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC1A3P43003 542 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCL11P51671 97 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF136P52737 540 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IST1P53990 364 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB1AP62820 205 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARG2P78540 354 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HOXC5Q00444 222 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SKP2Q13309 424 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MED21Q13503 144 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEFB109BQ30KR1 87 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRT80Q6KB66 452 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CPOQ8IVL8 374 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AQP11Q8NBQ7 271 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR52M1Q8NGK5 317 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM239Q8WW34 195 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LIPHQ8WWY8 451 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TM9SF4Q92544 642 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB24Q969Q5 203 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C5orf34Q96MH7 638 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSD2Q9BQI7 771 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UCK2Q9BZX2 261 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ING2Q9H160 280 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TREM1Q9NP99 234 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR83Q9NYM4 423 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USE1Q9NZ43 259 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRFN1Q9P244 771 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WIF1Q9Y5W5 379 aa5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A087WZY1 265 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0B4J2E0 115 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GWA3 101 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GX12 115 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SH3PXD2BA1X283 911 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A8MXE2 369 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRSS44E7EML9 344 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H3BN98 237 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FFAR1O14842 300 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPPINO95925 133 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAP00813 363 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIST1H2ABP04908 130 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ALPLP05186 524 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNR1P21554 472 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHMP24386 653 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FPR2P25090 351 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THBS2P35442 1172 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLA2G5P39877 138 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF1P41567 113 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AQP4P55087 323 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UCNP55089 124 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SOX8P57073 446 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF117Q03924 483 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q0VFX4 171 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MERTKQ12866 999 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C5orf46Q6UWT4 87 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APOOLQ6UXV4 268 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.08□□□□□ -1.6
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms