RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 IGHMP01871 453 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ADORA3P0DMS8 318 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 RAD23AP54725 363 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 TFF3Q07654 80 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 GUSBP1Q15486 140 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ALG10Q5BKT4 473 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 TM9SF2Q99805 663 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 GLRX2Q9NS18 164 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.94□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 DOCK7Q96N67 2140 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ZNF724A8MTY0 619 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 MCIDASD6RGH6 385 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 OR6A2O95222 327 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 FOSL1P15407 271 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 SLC6A6P31641 620 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 TIMP3P35625 211 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 TAF11Q15544 211 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 SLC36A3Q495N2 470 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 TMEM225Q6GV28 225 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 OR2A2Q6IF42 318 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ABHD3Q8WU67 409 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 SAMD8Q96LT4 415 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 VCX3BQ9H321 246 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 INIPQ9NRY2 104 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.93□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 E9PLN8 166 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 BHLHE40O14503 412 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 GPR171O14626 319 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ARPC3O15145 178 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 RNF13O43567 381 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 SOX14O95416 240 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 TXNDC12O95881 172 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 CRHP06850 196 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 CD14P08571 375 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 CRISP1P54107 249 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ADAM8P78325 824 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 FAM122BQ7Z309 247 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 UEVLDQ8IX04 471 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 KDM8Q8N371 416 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 TMEM45BQ96B21 275 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 MBOAT4Q96T53 435 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 MED12LQ86YW9 2145 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ATRQ13535 2644 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 ZAR1LA6NP61 321 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 IMPA2O14732 288 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 TOXO94900 526 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 F13BP05160 661 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 GLI4P10075 376 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 HLA-DOBP13765 273 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 CDK5Q00535 292 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 NPRL3Q12980 569 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 LNX2Q8N448 690 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-208ENST00000529677 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms