RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, human

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3A3-208	ENST00000489537	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	PXK	Q7Z7A4	578 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	GLRX5	Q86SX6	157 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	TMEM156	Q8N614	296 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SETD6	Q8TBK2	473 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	DOK4	Q8TEW6	326 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SMPDL3B	Q92485	455 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	PTP4A1	Q93096	173 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	KLHL15	Q96M94	604 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	CMTM3	Q96MX0	182 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	FRMD6	Q96NE9	622 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	WDFY2	Q96P53	400 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	OR5M11	Q96RB7	305 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SLITRK2	Q9H156	845 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	RAX	Q9Y2V3	346 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	OR2W5	A6NFC9	320 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537		M0R129	80 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	WWP2	O00308	870 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	RNF13	O43567	381 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SLC19A2	O60779	497 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF254	O75437	659 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	CBR3	O75828	277 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	STK17B	O94768	372 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	TPPP	O94811	219 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	TIAF1	O95411	115 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	MT-CO3	P00414	261 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	BGLAP	P02818	100 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	RAF1	P04049	648 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	HRG	P04196	525 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537		P04436	131 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SERPINA7	P05543	415 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	KRT8	P05787	483 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	MYF5	P13349	255 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	PRKCA	P17252	672 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SPI1	P17947	270 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	CEL	P19835	753 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	FUT4	P22083	530 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	TALDO1	P37837	337 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	CASP3	P42574	277 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	CRYBB2	P43320	205 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	ENTPD1	P49961	510 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	GAS1	P54826	345 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SCAND1	P57086	179 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	GPR85	P60893	370 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	NCS1	P62166	190 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SIRPA	P78324	504 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SLC35A1	P78382	337 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	PUDP	Q08623	228 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	PCOLCE	Q15113	449 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SSX1	Q16384	188 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	CDON	Q4KMG0	1287 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	HACD4	Q5VWC8	232 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	LEG1	Q6P5S2	330 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	CBLN3	Q6UW01	205 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	FAM122B	Q7Z309	247 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	PRR22	Q8IZ63	422 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	GATS	Q8NAP1	163 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	OR4K13	Q8NH42	304 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	NDNF	Q8TB73	568 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3A3-208	ENST00000489537	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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