RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM157B	P0CG42	384 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	B4GALT1	P15291	398 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SELE	P16581	610 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	MAK	P20794	623 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	UQCRC2	P22695	453 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	KRTAP10-3	P60369	221 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	RELB	Q01201	579 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CAMK2D	Q13557	499 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CHI3L2	Q15782	390 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PGS1	Q32NB8	556 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	XKR7	Q5GH72	579 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SNX32	Q86XE0	403 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	RNF130	Q86XS8	419 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PARP8	Q8N3A8	854 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	LRR1	Q96L50	414 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	MECR	Q9BV79	373 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		12	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CDHR4	A6H8M9	788 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390		A8MXK9	166 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SRRM5	B3KS81	715 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM233	B4DJY2	109 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	C3orf80	F5H4A9	247 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	HMGN4	O00479	90 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PLIN3	O60664	434 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	UBOX5	O94941	541 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PLAT	P00750	562 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	GKN3P	P0CG01	181 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CPA3	P15088	417 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PDCD1	Q15116	288 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	C8orf74	Q6P047	294 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	REC114	Q7Z4M0	266 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ANKFN1	Q8N957	763 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	FMO2	Q99518	471 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	FOXB1	Q99853	325 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	AIM2	O14862	343 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CLPX	O76031	633 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV3-13	P01766	116 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	LCK	P06239	509 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ABHD2	P08910	425 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC6A9	P48067	706 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF81	P51508	661 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	AQP5	P55064	265 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CLDN8	P56748	225 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ERVS71-1	P61550	626 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PAX8	Q06710	450 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	RBBP4	Q09028	425 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SYPL1	Q16563	259 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CARD17	Q5XLA6	110 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	MZB1	Q8WU39	189 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	DIRC2	Q96SL1	478 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	NPTN	Q9Y639	398 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390		M0R082	166 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	TM9SF1	O15321	606 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PLXNB1	O43157	2135 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ERLIN1	O75477	346 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV1-46	P01743	117 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV2-70	P01814	119 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	G6PD	P11413	515 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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