RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C8orf89P0DMQ9 161 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MYBL1P10243 752 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMOD1P28289 359 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 YWHABP31946 246 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RFC2P35250 354 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRPHP41219 470 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMED10P49755 219 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CASP9P55211 416 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FOXA1P55317 472 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PPP1CBP62140 327 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HERV-K104P63124 156 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRADDP78560 199 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SRYQ05066 204 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CUL2Q13617 745 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FZD2Q14332 565 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LAGE3Q14657 143 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CASP8Q14790 479 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TIGITQ495A1 244 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LCN12Q6JVE5 192 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PNCKQ6P2M8 343 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HDDC2Q7Z4H3 204 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 P4HA3Q7Z4N8 544 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ASPGQ86U10 573 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLA2G4DQ86XP0 818 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM126BQ8IUX1 230 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SIAH3Q8IW03 269 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC36Q8IYA8 594 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF101Q8IZC7 436 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TTLQ8NG68 377 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR5D13Q8NGL4 314 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR4S2Q8NH73 311 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR5P3Q8WZ94 311 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNASE1L2Q92874 299 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 YIPF5Q969M3 257 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CFAP36Q96G28 342 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SDSLQ96GA7 329 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ERO1AQ96HE7 468 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC30A2Q9BRI3 323 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NDUFAF3Q9BU61 184 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NTMT1Q9BV86 223 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NLNQ9BYT8 704 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC19A3Q9BZV2 496 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRRC19Q9H756 370 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 YAE1D1Q9NRH1 226 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM161AQ9NX61 479 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 XCL2Q9UBD3 114 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MIOXQ9UGB7 285 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IKBKGQ9Y6K9 419 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ITIH6Q6UXX5 1313 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSPOAP1O95153 1857 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C5orf51A6NDU8 294 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KNCNA6PVL3 124 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C12orf77C9JDV5 145 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PSMA7O14818 248 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC30A4O14863 429 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CASKO14936 926 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CTDSPLO15194 276 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ALOX15BO15296 676 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NME2P1O60361 137 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BEST1O76090 585 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAB3DO95716 219 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HSPA4LO95757 839 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LDHAP00338 332 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C1QCP02747 245 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RLN1P04808 185 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ALDOBP05062 364 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KRT8P05787 483 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ETS2P15036 469 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 B4GALT1P15291 398 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PAICSP22234 425 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NNMTP40261 264 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EIF1P41567 113 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CDKN2BP42772 138 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAGEA4P43358 317 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RFX3P48380 749 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BIDP55957 195 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ASIC1P78348 528 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MERTKQ12866 999 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NME3Q13232 169 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HYAL4Q2M3T9 481 aa-0.81□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms