RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 TSTQ16762 297 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 COX20Q5RI15 118 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 VPS37AQ8NEZ2 397 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF417Q8TAU3 575 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SYNPRQ8TBG9 265 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SNX33Q8WV41 574 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 TMIGD2Q96BF3 282 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 OR51B6Q9H340 312 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 GRPEL1Q9HAV7 217 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 GPR160Q9UJ42 338 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 CHST2Q9Y4C5 530 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 AIM2O14862 343 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 FZD7O75084 574 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SHBGP04278 402 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF250P15622 560 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 GRPRP30550 384 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 LSP1P33241 339 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ATP4BP51164 291 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SELENOVP59797 346 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 HFEQ30201 348 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 LIN52Q52LA3 116 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINA11Q86U17 422 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 TAAR8Q969N4 342 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 TIMD4Q96H15 378 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 FOXB1Q99853 325 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 DECR2Q9NUI1 292 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 UBAP1Q9NZ09 502 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PPIAL4EA0A075B759 164 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM23A6NLE4 172 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PPIAL4DF5H284 164 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 MS4A18H0YCH9 400 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 UBL3O95164 117 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 HPRP00739 348 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINA5P05154 406 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PPIAL4FP0DN26 164 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 CCL2P13500 99 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 MAKP20794 623 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PCGF2P35227 344 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 MS4A18Q3C1V0 323 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 SKA3Q8IX90 412 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 TXNDC15Q96J42 360 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 LRR1Q96L50 414 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R36Q96LQ0 422 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 MMP24Q9Y5R2 645 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 AUP1Q9Y679 476 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD12-201ENST00000404162 ISPDA4D126 451 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TRAPPC2LH3BP13 241 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN34H7C241 214 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 CDKN2CP42773 168 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 HOXC5Q00444 222 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 CAMK2DQ13557 499 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 JAZF1Q86VZ6 243 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 UEVLDQ8IX04 471 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 KIR3DL3Q8N743 410 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ST7LQ8TDW4 575 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 CCL17Q92583 94 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TESCQ96BS2 214 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ULBP2Q9BZM5 246 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SAP30LQ9HAJ7 183 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A23A1A5C7 686 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC154A6NI56 674 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 FOXH1O75593 365 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 LCKP06239 509 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 GLO1Q04760 184 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 RBBP4Q09028 425 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF154Q13106 437 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SMU1Q2TAY7 513 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 RNF220Q5VTB9 566 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SPATC1Q76KD6 591 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 C1QL4Q86Z23 238 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF519Q8TB69 540 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC115Q96NT0 180 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MMP27Q9H306 513 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SLC17A7Q9P2U7 560 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 BTNL2Q9UIR0 455 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 FBXL3Q9UKT7 428 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms