RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	CLDN18	P56856	261 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NCALD	P61601	193 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FUT5	Q11128	374 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXF1	Q12946	379 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXF2	Q12947	444 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	BNIP2	Q12982	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FADD	Q13158	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	MYBPH	Q13203	477 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SELPLG	Q14242	412 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288		Q6ZWC4	215 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF550	Q7Z398	422 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FIG4	Q92562	907 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RCN3	Q96D15	328 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	CASK	O14936	926 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA0513	O60268	411 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TPST1	O60507	370 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TPST2	O60704	377 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	AQP8	O94778	261 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RCBTB2	O95199	551 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NTN1	O95631	604 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NPS	P0C0P6	89 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PRG2	P13727	222 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	GPX2	P18283	190 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	PTN	P21246	168 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SHC1	P29353	583 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TIMP3	P35625	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	HTR3A	P46098	478 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	NUDT2	P50583	147 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF136	P52737	540 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	MVD	P53602	400 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	SKP2	Q13309	424 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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