RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512242.5

COPB2-209, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 5

Gene COPB2, Length 848 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-209ENST00000512242 SLC35F4A4IF30 521 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ZNF726A6NNF4 738 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 C11orf98E9PRG8 122 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 H7C417 338 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 CD5LO43866 347 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 CALCRP30988 508 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 EFNA4P52798 201 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 DSCR9P59020 149 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PIGFQ07326 219 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 CAMK2DQ13557 499 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 MFSD13AQ14CX5 517 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 LINC01559Q495D7 138 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ANKS4BQ8N8V4 417 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 OR2M2Q96R28 347 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 MDFIQ99750 246 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 CA10Q9NS85 328 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 GMEB1Q9Y692 573 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 A8MV72 311 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 OR6A2O95222 327 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 CH25HO95992 272 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 HLA-HP01893 362 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 BGLAPP02818 100 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 OR4A8P0C604 315 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ADORA3P0DMS8 318 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 CD79AP11912 226 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 CBR1P16152 277 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 RBBP4Q09028 425 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 DPP10Q8N608 796 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 OR6N1Q8NGY5 312 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 BOD1Q96IK1 185 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 POFUT2Q9Y2G5 429 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 VSTM5A8MXK1 200 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PLPP3O14495 311 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PAX7P23759 505 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 THBS4P35443 961 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ARR3P36575 388 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 BIDP55957 195 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PRR20EP86478 221 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PRR20CP86479 221 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PRR20DP86480 221 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PRR20BP86481 221 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PRR20AP86496 221 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 HGFACQ04756 655 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PUDPQ08623 228 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 GGTLC2Q14390 218 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 LAPTM4AQ15012 233 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 NPTX1Q15818 432 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ADIPOQQ15848 244 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 MMEL1Q495T6 779 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 RABL3Q5HYI8 236 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ZNF613Q6PF04 617 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ZNF813Q6ZN06 617 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 SPATA21Q7Z572 469 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 MDP1Q86V88 176 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 WDFY1Q8IWB7 410 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 C20orf196Q8IYI0 205 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 TMEM123Q8N131 208 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 FOXN4Q96NZ1 517 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ARHGDIGQ99819 225 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-209ENST00000512242 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms