RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307106.3

SMIM4-201, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMIM4, Length 274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-201ENST00000307106 DUSP26Q9BV47 211 aa10.02□□□□□ -0.81
SMIM4-201ENST00000307106 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
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SMIM4-201ENST00000307106 SEC14L4Q9UDX3 406 aa10.02□□□□□ -0.81
SMIM4-201ENST00000307106 GIMAP2Q9UG22 337 aa10.02□□□□□ -0.81
SMIM4-201ENST00000307106 EMCNQ9ULC0 261 aa10.02□□□□□ -0.81
SMIM4-201ENST00000307106 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
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SMIM4-201ENST00000307106 PGS1Q32NB8 556 aa9.99□□□□□ -0.81
SMIM4-201ENST00000307106 CARD17Q5XLA6 110 aa9.99□□□□□ -0.81
SMIM4-201ENST00000307106 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.99□□□□□ -0.81
SMIM4-201ENST00000307106 ZNF627Q7L945 461 aa9.99□□□□□ -0.81
SMIM4-201ENST00000307106 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.99□□□□□ -0.81
SMIM4-201ENST00000307106 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.99□□□□□ -0.81
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