RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GALP	Q9UBC7	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TNXB	P22105	4242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLL5	B9A064	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SULT2B1	O00204	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PDPK1	O15530	556 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CD55	P08174	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ADH4	P08319	380 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PAX6	P26367	422 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR5	P85299	388 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR78	Q96P69	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGDIG	Q99819	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440		A6NDX4	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPA12A	O43301	675 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SUPT7L	O94864	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CPM	P14384	443 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	UCHL3	P15374	230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TACR3	P29371	465 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	GRIA1	P42261	906 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2E1	P51965	193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	RBBP4	Q09028	425 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10H3	O60404	316 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	H6PD	O95479	791 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL18	O95568	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	YEATS4	O95619	227 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDT14	O95848	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	LPL	P06858	475 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CD79A	P11912	226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	IMPDH2	P12268	514 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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