RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	GBA3	Q9H227	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PLPP1	O14494	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	APOL1	O14791	398 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TGOLN2	O43493	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	LCK	P06239	509 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	HTR5A	P47898	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	DIO1	P49895	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CLRN1	P58418	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PRAME	P78395	509 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CUL1	Q13616	776 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TFDP2	Q14188	446 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PRPSAP1	Q14558	356 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061		Q6ZR54	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	GALP	Q9UBC7	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TNXB	P22105	4242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	IGLL5	B9A064	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SULT2B1	O00204	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PDPK1	O15530	556 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	CD55	P08174	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ADH4	P08319	380 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PAX6	P26367	422 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PRR5	P85299	388 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR78	Q96P69	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ARHGDIG	Q99819	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNAP23-222	ENST00000626061		A6NDX4	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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