RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 TACSTD2P09758 323 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 ARR3P36575 388 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 GPR137CQ8N3F9 429 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 SVOPLQ8N434 492 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD42Q8N9B4 389 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD27Q96NW4 1050 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 C12orf10Q9HB07 376 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 CRLF2Q9HC73 371 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 LILRA1O75019 489 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT7P0C024 238 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 CHN2P52757 468 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 C1DQ13901 141 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 CEACAM16Q2WEN9 425 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf10Q5SRN2 563 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA21Q7Z572 469 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF786Q8N393 782 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 HPS1Q92902 700 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 TAAR8Q969N4 342 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 A4GALTQ9NPC4 353 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 M0R082 166 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 AIM2O14862 343 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 OR2T1O43869 369 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 IL2RGP31785 369 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 RGNQ15493 299 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 FAM69AQ5T7M9 428 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 LIPNQ5VXI9 398 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 C5orf46Q6UWT4 87 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 MDP1Q86V88 176 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC36Q8IYA8 594 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM123Q8N131 208 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 PIK3C3Q8NEB9 887 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 IL17RDQ8NFM7 739 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 OR9I1Q8NGQ6 314 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF417Q8TAU3 575 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 MAL2Q969L2 176 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 OR2M2Q96R28 347 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 BMP2P12643 396 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 GRPRP30550 384 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 NPRL3Q12980 569 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 MAVSQ7Z434 540 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 LSMEM1Q8N8F7 131 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 BBS10Q8TAM1 723 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 GTF2H4Q92759 462 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 USP22Q9UPT9 525 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 SH3PXD2BA1X283 911 aa21.53■■□□□ 1.04
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PTPRF-216ENST00000617451 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 C8BP07358 591 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 APEX1P27695 318 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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PTPRF-216ENST00000617451 ADRM1Q16186 407 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 CDK20Q8IZL9 346 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 UBASH3BQ8TF42 649 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 SLC38A4Q969I6 547 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 OR52B2Q96RD2 323 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 SNX18Q96RF0 628 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 NOX3Q9HBY0 568 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 DYNLRB1Q9NP97 96 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GWA3 101 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM120BA0PK00 339 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 CLIC1O00299 241 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 UBDO15205 165 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 ETS2P15036 469 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 HTR2AP28223 471 aa21.52■■□□□ 1.04
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PTPRF-216ENST00000617451 PHYHD1Q5SRE7 291 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 CROCCP2Q86T23 111 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 LINC01356Q8N9X3 169 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 RAD21L1Q9H4I0 556 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 B3GNT2Q9NY97 397 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 M0R3G1 203 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 SEC14L2O76054 403 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 ADRA2AP08913 450 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 NR4A1P22736 598 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRF-216ENST00000617451 KRT80Q6KB66 452 aa21.51■■□□□ 1.03
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