RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ROPN1L	Q96C74	230 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	NUS1	Q96E22	293 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GBF1	Q92538	1859 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	FXYD1	O00168	92 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MRAS	O14807	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SEC22B	O75396	215 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PDE5A	O76074	875 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	KRT6A	P02538	564 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	KRT6B	P04259	564 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GLUL	P15104	373 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	HMOX2	P30519	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OXTR	P30559	389 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR3A1	P47881	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	KRT6C	P48668	564 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CLDN8	P56748	225 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RPA4	Q13156	261 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	HTR4	Q13639	388 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RCAN2	Q14206	197 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MEP1B	Q16820	701 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908		Q6ZVQ6	151 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	AMER3	Q8N944	861 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SNX31	Q8N9S9	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	STMN2	Q93045	179 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GABRG3	Q99928	467 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ACTR8	Q9H981	624 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GID8	Q9NWU2	228 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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