RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 C3AR1Q16581 482 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CASP12Q6UXS9 341 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 RPTNQ6XPR3 784 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CBR4Q8N4T8 237 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 APH1AQ96BI3 265 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 RBP7Q96R05 134 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 NPAS1Q99742 590 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 FUZQ9BT04 418 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 Q9H521 79 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 UPB1Q9UBR1 384 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 RCE1Q9Y256 329 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 MEMO1Q9Y316 297 aa8.71□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 RIIAD1A6NNX1 92 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SERPINI2O75830 405 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 IL18BPO95998 194 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 RENP00797 406 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 IGHG1P01857 330 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CD14P08571 375 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF3P17036 446 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 MAKP20794 623 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 PRKACGP22612 351 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SHC1P29353 583 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 AQP2P41181 271 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 IST1P53990 364 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CLRN1P58418 232 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CDC42P60953 191 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TGFBR3Q03167 851 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SLC17A1Q14916 467 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 C4orf17Q53FE4 359 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TTC23Q5W5X9 447 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 FAHD1Q6P587 224 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SLC35D2Q76EJ3 337 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 AAED1Q7RTV5 226 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ADCK1Q86TW2 530 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 OR13C2Q8NGS9 318 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 OR6N1Q8NGY5 312 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF566Q969W8 418 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 RELTQ969Z4 430 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF570Q96NI8 536 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 APOL4Q9BPW4 351 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 OR52D1Q9H346 318 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 BCO1Q9HAY6 547 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 NTN4Q9HB63 628 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ASB6Q9NWX5 421 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 IL20Q9NYY1 176 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 USE1Q9NZ43 259 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TINAGQ9UJW2 476 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 PROCRQ9UNN8 238 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SPTA1P02549 2419 aa8.7□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 H0YC42 278 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 H0YJX3 145 aa8.69□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 EI24O14681 340 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms