RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485407.1

NHLRC3-205, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene NHLRC3, Length 623 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-205ENST00000485407 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 OR4K14Q8NGD5 310 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 SSC4DQ8WTU2 575 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 TWIST2Q8WVJ9 160 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 PSMF1Q92530 271 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 HAS2Q92819 552 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 TSLPQ969D9 159 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 FAM46BQ96A09 425 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 C8orf44Q96CB5 159 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 TM4SF18Q96CE8 201 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF503Q96F45 646 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 FCRL1Q96LA6 429 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF354BQ96LW1 612 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 KCNA7Q96RP8 456 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 CSF3RQ99062 836 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF559Q9BR84 538 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ATG101Q9BSB4 218 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF160Q9HCG1 818 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 MED4Q9NPJ6 270 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 CENPMQ9NSP4 180 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 C1orf109Q9NX04 203 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 CES1P1Q9UKY3 287 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa5□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ESPL1Q14674 2120 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 PCSK5Q92824 1860 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 STAB1Q9NY15 2570 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 UQCRHLA0A096LP55 91 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 TRPC5OSA6NMA1 111 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 C17orf105B2RV13 164 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ANKRD28O15084 1053 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 LSM1O15116 133 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 HDAC3O15379 428 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ITM2AO43736 263 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 GMFGO60234 142 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 PCDH7O60245 1069 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 FGF17O60258 216 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 TBX19O60806 448 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 PRAF2O60831 178 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 LDB3O75112 727 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ATP6V1G1O75348 118 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ZFAND5O76080 213 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 IGKV3-11P04433 115 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 IFNA16P05015 189 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ATP1B1P05026 303 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 CSN3P07498 182 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 UQCRHP07919 91 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 PRPS2P11908 318 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 CPMP14384 443 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 TNNI3P19429 210 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 BGNP21810 368 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ARRB2P32121 409 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 MPIP34949 423 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 RPL3P39023 403 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 XKP51811 444 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 NUDT6P53370 316 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 PSPHP78330 225 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 PMP22Q01453 160 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 Q0VFX4 171 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 FUT7Q11130 342 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 KLRB1Q12918 225 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 MFAP5Q13361 173 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 TTMPQ5BVD1 217 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 C18orf63Q68DL7 685 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 CLEC6AQ6EIG7 209 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 FAM71E1Q6IPT2 247 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 LANCL3Q6ZV70 420 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 TEX45Q8NA69 505 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 APCDD1LQ8NCL9 501 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 C17orf47Q8NEP4 570 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 OR7G1Q8NGA0 311 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 OR5L2Q8NGL0 311 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 NUBPLQ8TB37 319 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 C16orf78Q8WTQ4 265 aa4.99□□□□□ -1.61
NHLRC3-205ENST00000485407 FIG4Q92562 907 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms