RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 NANSQ9NR45 359 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 NDE1Q9NXR1 346 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 RIMS3Q9UJD0 308 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF115Q9Y4L5 304 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 NOX1Q9Y5S8 564 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRN3E7EW58 273 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MS4A18H0YCH9 400 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 CH25HO95992 272 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SERPINA1P01009 418 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST1H2ABP04908 130 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ADORA3P0DMS8 318 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 UMPSP11172 480 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 AHCYP23526 432 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MNAT1P51948 309 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ST3GAL3Q11203 375 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ACKR1Q16570 336 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF74Q16587 644 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MS4A18Q3C1V0 323 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 IFI44LQ53G44 452 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 HMBOX1Q6NT76 420 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 KLHL17Q6TDP4 642 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 FKBP9P1Q75LS8 142 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 CBLL1Q75N03 491 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 PGAM4Q8N0Y7 254 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR137CQ8N3F9 429 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 PIK3C3Q8NEB9 887 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 OR52N5Q8NH56 324 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST1H2ACQ93077 130 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 PIGTQ969N2 578 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 PRRC1Q96M27 445 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 HS6ST2Q96MM7 605 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ALPK1Q96QP1 1244 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 PRSS27Q9BQR3 290 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM204Q9BSN7 226 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF229Q9UJW7 825 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS6KA6Q9UK32 745 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 AMDHD2Q9Y303 409 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 PLPP3O14495 311 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 CLOCKO15516 846 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF432O94892 652 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM107AO95990 144 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 HPRP00739 348 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MT-ND1P03886 318 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 CD53P19397 219 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MXRA7P84157 204 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 BSPH1Q075Z2 132 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 TESK1Q15569 626 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 DEFB113Q30KQ7 82 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 C16orf89Q6UX73 402 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM108Q6UXF1 575 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SPNS3Q6ZMD2 512 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 PXKQ7Z7A4 578 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 VTCN1Q7Z7D3 282 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC197Q8NCU1 140 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKK1Q8NFD2 765 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM239Q8WW34 195 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 HSH2DQ96JZ2 352 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC17A5Q9NRA2 495 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ARL8BQ9NVJ2 186 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 MED31Q9Y3C7 131 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC25A15Q9Y619 301 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF726A6NNF4 738 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf98E9PRG8 122 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 HS3ST1O14792 307 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 UPK3AO75631 287 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 SERPINI2O75830 405 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 WNT11O96014 354 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 PLAUP00749 431 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 IGF2P01344 180 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 NCK1P16333 377 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 PRPS1P60891 318 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 GLYATQ6IB77 296 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 NKAIN4Q8IVV8 208 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM255BQ8WV15 326 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 SGTBQ96EQ0 304 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2M2Q96R28 347 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CCL19Q99731 98 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 FNDC11Q9BVV2 318 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CXXC4Q9H2H0 198 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 OBP2BQ9NPH6 170 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms