RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	AQP1	P29972	269 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	GRPR	P30550	384 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FABP6	P51161	128 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDN17	P56750	224 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RBBP4	Q09028	425 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SELPLG	Q14242	412 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OR1Q1	Q15612	314 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738		H7C417	338 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SSX4	O60224	188 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	NCALD	P61601	193 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGDIG	Q99819	225 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		15.45	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A096LNT2	108 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MS4A18	H0YCH9	400 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	FMO6P	O60774	539 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SASH3	O75995	380 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	BGLAP	P02818	100 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MTPN	P58546	118 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	DUSP7	Q16829	419 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM123	Q8N131	208 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SMYD1	Q8NB12	490 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	NPHS2	Q9NP85	383 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM160	Q9NX00	188 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MOK	Q9UQ07	419 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ANK2	Q01484	3957 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ANGPT2	O15123	496 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC43A1	O75387	559 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV3-15	P01624	115 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV1-44	P01699	117 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT6	P53370	316 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CDH12	P55289	794 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MST1L	Q2TV78	715 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SCAI	Q8N9R8	606 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2M2	Q96R28	347 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNK17	Q96T54	332 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	EPYC	Q99645	322 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	BEX2	Q9BXY8	128 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR35	Q9HC97	309 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SELENON	Q9NZV5	590 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A096LPE4	126 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PPZ6	126 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738		M0QX08	132 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R3H8	397 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	HPR	P00739	348 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	HLA-DOB	P13765	273 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CBL	P22681	906 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	GZMM	P51124	257 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	DSCR9	P59020	149 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB35	Q15286	201 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	NPTX1	Q15818	432 aa		15.42	■□□□□ 0.06

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