RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340840.6

TRERF1-201, Transcript of transcriptional regulating factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRERF1, Length 4,174 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1-201ENST00000340840 HAVCR1Q96D42 359 aa8.66□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.66□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.66□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 MLXQ9UH92 298 aa8.66□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 A0A1W2PPC1 479 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 PHYHO14832 338 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 PRAMEF2O60811 474 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 RGS11O94810 467 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 SIX6O95475 246 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 RAB3DO95716 219 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 CTSEP14091 401 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 BTCP35070 178 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 P2RX1P51575 399 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 RUNX2Q13950 521 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ALG10Q5BKT4 473 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ZNF425Q6IV72 752 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 FAAP20Q6NZ36 180 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 GATSQ8NAP1 163 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ZNF511Q8NB15 262 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 THAP6Q8TBB0 222 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ORAI1Q96D31 301 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 MOKQ9UQ07 419 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 A0A0B4J2E0 115 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 A0A1B0GX12 115 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 PRSS38A1L453 326 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 H0YGG7 62 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 H7C2Y5 167 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 SCDO00767 359 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 LAMTOR5O43504 91 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 FGF17O60258 216 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 BRINP1O60477 761 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 NDUFB6O95139 128 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 CEACAM5P06731 702 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 CPN1P15169 458 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 SOX9P48436 509 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 TPMTP51580 245 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 SORDQ00796 357 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 TAF13Q15543 124 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 A0A0G2JK05 382 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ZNF749O43361 778 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 CSN2P05814 226 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ANKRD34CP0C6C1 535 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 CCKBRP32239 447 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ELP2Q6IA86 826 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 SSX6Q7RTT6 188 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 VN1R4Q7Z5H5 301 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 CMIPQ8IY22 773 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 CHST4Q8NCG5 386 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 NT5CQ8TCD5 201 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 TMEM106AQ96A25 262 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 RASD2Q96D21 266 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 GPR174Q9BXC1 333 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRERF1-201ENST00000340840 TVP23AA6NH52 213 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 EFCAB7A8K855 629 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 DISC1C4P0D8 188 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 MPC2O95563 127 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 THY1P04216 161 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 AMY2AP04746 511 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 FBXO45P0C2W1 286 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 UBBP0CG47 229 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 PNMTP11086 282 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 LIPNQ5VXI9 398 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 TMEM65Q6PI78 240 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 ZNF546Q86UE3 836 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 ZNF248Q8NDW4 579 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.65□□□□□ -1.03
TRERF1-201ENST00000340840 METTL21AQ8WXB1 218 aa8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms