RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF416Q9BWM5 594 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 BARHL1Q9BZE3 327 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 S100A14Q9HCY8 104 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF221Q9UK13 617 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 EVPLQ92817 2033 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 PLPP1O14494 284 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 SGCEO43556 437 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 TYROBPO43914 113 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 GPRIN2O60269 458 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 CD14P08571 375 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 ARRB2P32121 409 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 CATR1Q13166 79 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 SYT14P1Q58G82 188 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF425Q6IV72 752 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 VHLLQ6RSH7 139 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 GDPD3Q7L5L3 318 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 MARCH3Q86UD3 253 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 NRMQ8IXM6 262 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 GPR148Q8TDV2 347 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 OR2A5Q96R48 311 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 ALG8Q9BVK2 526 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 WDR37Q9Y2I8 494 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 CITO14578 2027 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 TRIM64BA6NI03 449 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 H0YAE9 185 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 J3QLW9 94 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 FBP2O00757 339 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 PRKYO43930 277 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF19P17023 458 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 SSTR4P31391 388 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 SOX3P41225 446 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 RAB31Q13636 194 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 PPA1Q15181 289 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 CHRFAM7AQ494W8 412 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 AHSA2Q719I0 299 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 CRIPAKQ8N1N5 446 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 OR51A2Q8NGJ7 313 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM43Q9BTV4 400 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 KIAA1456Q9P272 454 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 CTSFQ9UBX1 484 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 U3KQV3 271 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 A0A0X1KG70 313 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 ACOD1A6NK06 481 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 ALG1L2C9J202 215 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 F5H5K5 113 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 SNPHO15079 494 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 BPNT1O95861 308 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 BMP5P22003 454 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 PTPN6P29350 595 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 RAB6CQ53S08 254 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 CD163Q86VB7 1156 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 SLC25A45Q8N413 288 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 TSLPQ969D9 159 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 C12orf49Q9H741 205 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 PARP14Q460N5 1801 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 NDUFB3O43676 98 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 FGF17O60258 216 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 TRMUO75648 421 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 KCNK2O95069 426 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 BIDP55957 195 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 TSPAN31Q12999 210 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 RNF220Q5VTB9 566 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 TPRA1Q86W33 373 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 OR2M7Q8NG81 312 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 PSMF1Q92530 271 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 C10orf90Q96M02 699 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-212ENST00000591126 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms