RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ARHGEF9O43307 516 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CYTIPO60759 359 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 RAMP1O60894 148 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 LGI1O95970 557 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CD8BP10966 210 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 POU2F1P14859 743 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CD247P20963 164 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 PTNP21246 168 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 AGTR1P30556 359 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CRYBA2P53672 197 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 NCALDP61601 193 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SLC35A1P78382 337 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 LIPEQ05469 1076 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 OR1Q1Q15612 314 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 OR7A5Q15622 319 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 VHLLQ6RSH7 139 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CCDC80Q76M96 950 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 P3H2Q8IVL5 708 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 MICU2Q8IYU8 434 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 OR2T12Q8NG77 320 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 FAM222BQ8WU58 562 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SLC35B4Q969S0 331 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 Q96MF0 132 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 MCHR1Q99705 422 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ARHGDIGQ99819 225 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 PSD2Q9BQI7 771 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 POTEKPQ9BYX7 375 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 MPDZO75970 2070 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 NME4O00746 187 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 AKR7A3O95154 331 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 IGLV1-40P01703 118 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CD53P19397 219 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 TNFRSF1BP20333 461 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CBLP22681 906 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 PRDX6P30041 224 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 KDELR2P33947 212 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 IDUAP35475 653 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CD79BP40259 229 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 MAP2K6P52564 334 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SLC7A2P52569 658 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 PSME3P61289 254 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 VEZF1Q14119 521 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 NPTX1Q15818 432 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 NRF1Q16656 503 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ULK3Q6PHR2 472 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 TMEM99Q8N816 258 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 TRIM2Q9C040 744 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SELENONQ9NZV5 590 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ARID1AO14497 2285 aa8.52□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 TRIM64BA6NI03 449 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 LIPT2A6NK58 231 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 ZNF716A6NP11 495 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 GSTA4O15217 222 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 NPIPB7O75200 414 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 DCTN3O75935 186 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 GPIP06744 558 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 EDNRAP25101 427 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 NTF4P34130 210 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 PEX19P40855 299 aa8.52□□□□□ -1.05
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