RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-240	ENST00000495293	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293		H3BNH8	94 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FBP2	O00757	339 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ARPC2	O15144	300 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	NME2P1	O60361	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	E2F6	O75461	281 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF24	P17028	368 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CNR1	P21554	472 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	GNLY	P22749	145 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	MYF6	P23409	242 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	HPCAL1	P37235	193 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PSMB10	P40306	273 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	DGKQ	P52824	942 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SLC37A1	P57057	533 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FUT7	Q11130	342 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293		Q6ZSR9	355 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	EID3	Q8N140	333 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	MDS2	Q8NDY4	140 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	DOK4	Q8TEW6	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	UCN3	Q969E3	161 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PPCDC	Q96CD2	204 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TSSK3	Q96PN8	268 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	C1orf50	Q9BV19	199 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	DPY30	Q9C005	99 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	AIG1	Q9NVV5	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ATM	Q13315	3056 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293		A0A1B0GUH1	482 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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