RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334		A0A075B6Q4	140 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		A0A0U1RQS6	177 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	FAM189A1	O60320	539 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	FCMR	O60667	390 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TNFSF13	O75888	250 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	IGHG4	P01861	327 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC130	P13994	396 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NPR2	P20594	1047 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CDH4	P55283	916 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TAS2R19	P59542	299 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MECOM	Q03112	1051 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SLC15A2	Q16348	729 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	FAM228A	Q86W67	206 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ARPC1A	Q92747	370 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NT5C3B	Q969T7	300 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PAGE5	Q96GU1	130 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SEC22A	Q96IW7	307 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SUN2	Q9UH99	717 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SCN2A	Q99250	2005 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		A0A0G2JLM5	398 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	HEATR9	A2RTY3	570 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		A6NDX4	124 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		F5H6K3	240 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	UGT1A9	O60656	530 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ATP5L	O75964	103 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	AP2A1	O95782	977 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NDUFB10	O96000	172 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RFC4	P35249	363 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MAP3K8	P41279	467 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	EPS15	P42566	896 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SYK	P43405	635 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	KLRC3	Q07444	240 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PPP1R7	Q15435	360 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NRF1	Q16656	503 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CASC10	Q5T4H9	136 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CARD17	Q5XLA6	110 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		Q6ZN92	141 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CEP112	Q8N8E3	955 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		Q8N9L7	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		Q8N9W7	124 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	OR9G1	Q8NH87	305 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PIGC	Q92535	297 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	FAM104A	Q969W3	186 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RBKS	Q9H477	322 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	POLE4	Q9NR33	117 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NPTN	Q9Y639	398 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		H0YIV9	168 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RTL8C	O15255	209 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97

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