RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 AVPI1Q5T686 147 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 KDM8Q8N371 416 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC63Q8NA47 563 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 OR4M2Q8NGB6 313 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF416Q9BWM5 594 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 TAPBPLQ9BX59 468 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 NTN4Q9HB63 628 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 FZR1Q9UM11 496 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 SEC14L2O76054 403 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 VAMP5O95183 116 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 AGR2O95994 175 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 FSHBP01225 129 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CHRM4P08173 479 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 FGF4P08620 206 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ABHD2P08910 425 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 NAT2P11245 290 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 PRPS1L1P21108 318 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CXCR1P25024 350 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CAPZA2P47755 286 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ZP4Q12836 540 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 GPAT3Q53EU6 434 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 DCAF12L2Q5VW00 463 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 REP15Q6BDI9 236 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 OR4F3Q6IEY1 312 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf107Q8IVU9 208 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC58Q96CX6 371 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 C3orf30Q96M34 536 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 GPR35Q9HC97 309 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ARMCX1Q9P291 453 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 OPN4Q9UHM6 478 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 J3QLI3 93 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 FAAHO00519 579 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 FRS3O43559 492 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CHRNGP07510 517 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 FPR2P25090 351 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 GLRXP35754 106 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEB1P43366 347 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN17P56750 224 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 EPS8Q12929 822 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CEACAM16Q2WEN9 425 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 XKR7Q5GH72 579 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 KIF18AQ8NI77 898 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 RASD1Q9Y272 281 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CDC14BO60729 498 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF432O94892 652 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 C1QCP02747 245 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT17P0C025 328 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF35P13682 527 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 PRTN3P24158 256 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ALKBH6Q3KRA9 238 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 FNDC5Q8NAU1 212 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ANKK1Q8NFD2 765 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 OR4A15Q8NGL6 344 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF75AQ96N20 296 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 C7orf69Q9H7B7 122 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP73A6NFT4 308 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 RIPK2O43353 540 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 HLA-HP01893 362 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 G6PDP11413 515 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 SYPL1Q16563 259 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 GSTA3Q16772 222 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 TUSC1Q2TAM9 212 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CMIPQ8IY22 773 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ANKFN1Q8N957 763 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 AGR3Q8TD06 166 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 SLC38A1Q9H2H9 487 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF385DQ9H6B1 395 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP13Q9UII6 198 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 WNK2Q9Y3S1 2297 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 AGAP5A6NIR3 686 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 POM121CA8CG34 1229 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 A8MVM7 634 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 SLC43A1O75387 559 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 UQCRC2P22695 453 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CRHR1P34998 444 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CCT5P48643 541 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 PIGFQ07326 219 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 PCLAFQ15004 111 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 FXNQ16595 210 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms