RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 ARSGQ96EG1 525 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 ICAM5Q9UMF0 924 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 THAP4Q8WY91 577 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 C5AR2Q9P296 337 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPN3-201ENST00000262539 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 SLC6A7Q99884 636 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 C2orf42Q9NWW7 574 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 AASSQ9UDR5 926 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPN3-201ENST00000262539 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.56□□□□□ -1.2
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