RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	C7orf66	A4D0T2	115 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	SHISA7	A6NL88	538 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	PHYH	O14832	338 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	RDH16	O75452	317 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	GLCE	O94923	617 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	NTN1	O95631	604 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	CT62	P0C5K7	136 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF806	P0C7X5	589 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	EPX	P11678	715 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	FUT1	P19526	365 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	S1PR1	P21453	382 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	EDNRA	P25101	427 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	RCVRN	P35243	200 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	CENPA	P49450	140 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	EMD	P50402	254 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	SCAND1	P57086	179 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	PSG6	Q00889	435 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	CCIN	Q13939	588 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	LIPH	Q8WWY8	451 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	WDR70	Q9NW82	654 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516		A0A0B4J293	547 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516		A0A0G2JK05	382 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR2B3	O76000	313 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	IGLV3-19	P01714	112 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	NPIPA8	P0DM63	369 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ACVR1B	P36896	505 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC6A8	P48029	635 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	E2F1	Q01094	437 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	HHEX	Q03014	270 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	FUT7	Q11130	342 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPR135	Q8IZ08	494 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ELOA3	Q8NG57	546 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	UPRT	Q96BW1	309 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	RNF31	Q96EP0	1072 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	RADIL	Q96JH8	1075 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	BRD7	Q9NPI1	651 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	MCUB	Q9NWR8	336 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	LRP4	O75096	1905 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516		H0Y8X5	98 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	DNAJB6	O75190	326 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	CALCB	P10092	127 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANXA3	P12429	323 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	PVR	P15151	417 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	HPGD	P15428	266 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	LSS	P48449	732 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	DCAF7	P61962	342 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	KRT74	Q7RTS7	529 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		12.86	□□□□□ -0.35

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