RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	COX15	Q7KZN9	410 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	DOK4	Q8TEW6	326 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	PPCDC	Q96CD2	204 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	OR52E6	Q96RD3	313 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	NPAS2	Q99743	824 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	LYRM4	Q9HD34	91 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	PISD	Q9UG56	409 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		4.03	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SCN2A	Q99250	2005 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GX78	115 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934		A6NL46	340 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CFLAR	O15519	480 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	FGF17	O60258	216 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TBX19	O60806	448 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CTNS	O60931	367 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CREG1	O75629	220 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	STK17B	O94768	372 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GPR75	O95800	540 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	C6orf47	O95873	294 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	IL6	P05231	212 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TFAP2A	P05549	437 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	FH	P07954	510 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NR2F1	P10589	423 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	PTPN6	P29350	595 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	PRDX6	P30041	224 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GABRA5	P31644	462 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	KRT20	P35900	424 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	CDKN2C	P42773	168 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	XCR1	P46094	333 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	XK	P51811	444 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GAS1	P54826	345 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	RAB38	P57729	211 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	KCNK10	P57789	538 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	HBA1	P69905	142 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	TNFRSF17	Q02223	184 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	STX5	Q13190	355 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LINS1-210	ENST00000560934	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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