RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 VLDLRP98155 873 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 FAM27E3Q08E93 113 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 OR6S1Q8NH40 331 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 PFN4Q8NHR9 129 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 MARVELD3Q96A59 401 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 C7orf34Q96L11 122 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 EMC3Q9P0I2 261 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 RHCGQ9UBD6 479 aa14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 PIP5K1CO60331 668 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 CD79BP40259 229 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 SORDQ00796 357 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 MS4A2Q01362 244 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 BNIP1Q12981 228 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ZNF74Q16587 644 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 GPAT4Q86UL3 456 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 KDM8Q8N371 416 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 EPYCQ99645 322 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 PRSS50Q9UI38 385 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.5□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ENO4A6NNW6 628 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 OR2T1O43869 369 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 GMNNO75496 209 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 HPRP00739 348 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 THRBP10828 461 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 UGT2B10P36537 528 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 PYURFQ96I23 114 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 THTPAQ9BU02 230 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 TCRBV5S2A0A599 114 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 GPR171O14626 319 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 DIRAS1O95057 198 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 CH25HO95992 272 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 IGHV3-9P01782 118 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 POU2F1P14859 743 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 PCYT1AP49585 367 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 POU4F3Q15319 338 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 LCN8Q6JVE9 175 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 CASP12Q6UXS9 341 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 SCAIQ8N9R8 606 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 LINC01560Q8TB33 94 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 TMEM239Q8WW34 195 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 TMEM45BQ96B21 275 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 LRRC46Q96FV0 321 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 RASD1Q9Y272 281 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.48□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ITPR2Q14571 2701 aa14.47□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 TACC2O95359 2948 aa14.47□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ACOT8O14734 319 aa14.47□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 GYG2O15488 501 aa14.47□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 MT-ATP6P00846 226 aa14.47□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 MT-ND1P03886 318 aa14.47□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 HLA-DOBP13765 273 aa14.47□□□□□ -0.09
GCN1-209ENST00000551920 ST3GAL3Q11203 375 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms