RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TYK2P29597 1187 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMOX2P30519 316 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLRXP35754 106 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALK2Q01415 458 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SKP2Q13309 424 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCST2Q5T1A1 773 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NIPAL3Q6P499 406 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM99Q8N816 258 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METTL6Q8TCB7 284 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITPKCQ96DU7 683 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPIAL4DF5H284 164 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STX16O14662 325 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM24O75264 130 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHMP01871 453 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HLA-HP01893 362 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYZAPP0CAP1 466 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD79AP11912 226 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF12P17014 697 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAKP20794 623 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF75DP51815 510 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEKQ02763 1124 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DOC2BQ14184 412 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR68Q15743 365 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGARPQ8TDB4 240 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EGLN2Q96KS0 407 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR51B6Q9H340 312 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIMM22Q9Y584 194 aa8.61□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AGAP5A6NIR3 686 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 E7ESA3 106 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKAP10O43572 662 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF432O94892 652 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSTAP01040 98 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SBK2P0C263 348 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD80P33681 288 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSTM5P46439 218 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLO1Q04760 184 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEACAM7Q14002 265 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR7A5Q15622 319 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF385BQ569K4 471 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM225Q6GV28 225 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOXRED1Q6NXP6 359 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX33Q8WV41 574 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PBKQ96KB5 322 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNA7Q96RP8 456 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIGUQ9H490 435 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPHS2Q9NP85 383 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa8.6□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM72A0PK05 275 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM187AA6NFU0 413 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD28O15084 1053 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCN2BO60939 215 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLATP00750 562 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM157BP0CG42 384 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF35P13682 527 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms