RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513274.5

COPB2-211, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 3

Gene COPB2, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-211ENST00000513274 A8MVM7 634 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 ZNF587BE7ETH6 402 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 FAAHO00519 579 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 CBLP22681 906 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 DSTNP60981 165 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 GSTA3Q16772 222 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 LIN52Q52LA3 116 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 C1orf140Q5VVS0 124 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 OGFOD2Q6N063 350 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 WDR93Q6P2C0 686 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 CREB3L2Q70SY1 520 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 SERPINA11Q86U17 422 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 EPHX4Q8IUS5 362 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 ZNF440Q8IYI8 595 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 SLC38A2Q96QD8 506 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 PRR14Q9BWN1 585 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 HAO1Q9UJM8 370 aa9.98□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 SH3PXD2BA1X283 911 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 SLC22A3O75751 556 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 CRYAAP02489 173 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 CELA3BP08861 270 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 TFPTP0C1Z6 253 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 OR4A8P0C604 315 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 IGFBP5P24593 272 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 CALCRP30988 508 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 SERPINF1P36955 418 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 RPS5P46782 204 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 P2RY4P51582 365 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 MVDP53602 400 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 CLDN17P56750 224 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 IL1RL1Q01638 556 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 ANKRD16Q6P6B7 361 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 VPS33AQ96AX1 596 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 TMEM19Q96HH6 336 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 TPT1P8Q9HAU6 139 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 CA10Q9NS85 328 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 KCNS2Q9ULS6 477 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 CHST2Q9Y4C5 530 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 FKBP7Q9Y680 259 aa9.97□□□□□ -0.81
COPB2-211ENST00000513274 VWC2LB2RUY7 222 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 HDAC3O15379 428 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 SEC14L2O76054 403 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 AHSA1O95433 338 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 TGFAP01135 160 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 CSF3P09919 207 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 NUDT7P0C024 238 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 CECR9P0C854 216 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 SRD5A1P18405 259 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 NR4A2P43354 598 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 CAPZA2P47755 286 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 GZMKP49863 264 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 MAP2K6P52564 334 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 CRISP3P54108 245 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 NAAAQ02083 359 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 ADIPOQQ15848 244 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 FAM166AQ6J272 317 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 MREGQ8N565 214 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 OR9I1Q8NGQ6 314 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 RNF217Q8TC41 542 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 MAL2Q969L2 176 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 SOX7Q9BT81 388 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 CALML5Q9NZT1 146 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.96□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 A0A0G2JPF8 293 aa9.95□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 LRP5LA4QPB2 252 aa9.95□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.95□□□□□ -0.82
COPB2-211ENST00000513274 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms