RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509563.1

CANX-215, Transcript of calnexin, human

TSL 4

Gene CANX, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CANX-215	ENST00000509563	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	NT5E	P21589	574 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	GIF	P27352	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	NBL1	P41271	181 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	IL9R	Q01113	521 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	IL18	Q14116	193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	SYPL1	Q16563	259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	ZNF74	Q16587	644 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	HAGH	Q16775	308 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563		Q6ZVQ6	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563		H0YL77	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PSMD11	O00231	422 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	NXPH2	O95156	264 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	SEMA4F	O95754	770 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	CTSL	P07711	333 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	ALPI	P09923	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	ADRB3	P13945	408 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	CPN1	P15169	458 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	ZNF12	P17014	697 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	DRD3	P35462	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	FDFT1	P37268	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PSMD8	P48556	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	CDK16	Q00536	496 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	BST1	Q10588	318 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	STARD8	Q92502	1023 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PEX13	Q92968	403 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	PAK5	Q9P286	719 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CANX-215	ENST00000509563	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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