RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 C4orf47A7E2U8 309 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GABRPO00591 440 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SLC30A4O14863 429 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DYRK3O43781 588 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 REM1O75628 298 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SCRG1O75711 98 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CER1O95813 267 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD16AO95870 558 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 UMODP07911 640 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CD14P08571 375 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF28P17035 718 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF3P17036 446 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SPI1P17947 270 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ACP1P24666 158 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TNFSF8P32971 234 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 EVI2BP34910 448 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 THBS2P35442 1172 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 AQP2P41181 271 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CAPZA2P47755 286 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TGM4P49221 684 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 P2RX1P51575 399 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SLC26A5P58743 744 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PRPS1P60891 318 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ACTC1P68032 377 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ACTA1P68133 377 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DCDP81605 110 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 E2F1Q01094 437 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MC2RQ01718 297 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PLCXD2Q0VAA5 305 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CDC20Q12834 499 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 POU4F2Q12837 409 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RIN1Q13671 783 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IL11RAQ14626 422 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PCOLCEQ15113 449 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF79Q15937 498 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GXYLT1Q4G148 440 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MESTQ5EB52 335 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 EMC4Q5J8M3 183 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C22orf42Q6IC83 251 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MISPQ8IVT2 679 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TIGD4Q8IY51 512 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CYB561A3Q8NBI2 242 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR4K13Q8NH42 304 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF519Q8TB69 540 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ELP5Q8TE02 316 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TTC9Q92623 222 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 UFD1Q92890 307 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PMEPA1Q969W9 287 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FAM122AQ96E09 287 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PELI1Q96FA3 418 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 COX4I2Q96KJ9 171 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IMMP1LQ96LU5 166 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 Q96M85 177 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN32Q96QS1 320 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GAL3ST4Q96RP7 486 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NPAS1Q99742 590 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CTRCQ99895 268 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ALG8Q9BVK2 526 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SPRY4Q9C004 299 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FANCFQ9NPI8 374 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 COPS7AQ9UBW8 275 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RARRES3Q9UL19 164 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SSR3Q9UNL2 185 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 COPS3Q9UNS2 423 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF292O60281 2723 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SDK2Q58EX2 2172 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM72A0PK05 275 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ANKUB1A6NFN9 424 aa5.11□□□□□ -1.59
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